集装箱板房的单元个体由于其受空间限制，因此对空间的布局就显得尤为重要，一般集装箱单元为例宽度2.3m，高2.3m，长5.9m面积13平方米，可见这个集装箱板房是一个略微狭小而局促的空间，而其长度方向则远远大于一般室内单元空间。如何对其内部空间进行布局，是提高集装箱板房居住质量的关键环节，下面我们就对集装箱板房的内部空间进行介绍。
第一，集装箱板房的交通性空间。对于集装箱内部这种狭长型小空间的使用，不可避免要布置贯通的交通性空间。一般户内的交通通道空间宽度不应小于 600mm，大约相当于集装箱内部宽度的四分之一。因此，在室内布局时应尽可能地缩短交通空间，并对空间进行复合利用。
第二，集装箱板房的家具部品空间。家具部品空间包含了管井空间、贮藏空间、家具结构空间、被家具或者内部功能隔断包裹着的内部容积空间，以及各类无法使用的边角剩余空间。这类空间是用于实现建筑功能的部分，属于服务性空间。在集装箱箱体住宅中，家具部品空间主要包括：床、写字台、卫生间及其它隔断、沙发、桌子、椅子、各类储藏空间、以及相关的管道和设备空间。在用作办公使用时，一般包括大型文件柜和几套办公桌椅、以及相关设备。
第三，集装箱板房的使用性空间。使用性空间是指集装箱箱体除了家具部品空间之外的空间部分，可以被人体使用、感知。在集装箱箱体空间内，使用性空间不可避免的要与交通性空间相融合。由此可以将使用性空间划分为两类，一类是和交通空间共享的使用性空间，另一类便是开头所说位于箱体端部的“不受打扰的使用性空间”。
因此如何在设计集装箱板房的时候，最大限度地利用集装箱单元内长度方向的空间，充分发挥集装箱单元室内长度优势，分段模块化布局，是提高室内空间使用品质的关键要素。